Skeleton Crew volgt vier kinderen die een mysterieuze ontdekking doen op hun schijnbaar veilige thuisplaneet en vervolgens verdwalen in een vreemd en gevaarlijk sterrenstelsel waar ze paden kruisen met mensen als Jod Na Nawood. Hun weg naar huis vinden - en onwaarschijnlijke bondgenoten en vijanden ontmoeten - wordt een groter avontuur dan ze zich ooit hadden kunnen voorstellen.