Frankfurt, 1958. Johann Radmann is een jonge, ambitieuze advocaat. Via een tip van een journalist ontdekt hij dat bepaalde overheidsdiensten en instituten samenzweren om de Nazi-misdaden in de doofpot te houden. Johann werkt als een bezetene om het bewijsmateriaal te openbaren dat duizenden ex-SS'ers, van wie velen ondertussen succesvolle carrières hebben in de ambtenarij, linkt aan de gruwel van Auschwitz.

Im Labyrinth des Schweigens belicht een vaak vergeten periode uit de Duitse naoorlogse geschiedenis. Eind jaren '50, in volle economische heropleving, bleven de meeste Duitsers de ogen sluiten voor hun oorlogsverleden.