In Seizoen 2 moeten 13 nieuwe zaken met meer gecompliceerde moordenaars en ingewikkelde delicten worden opgelost. Rechercheur moordzaken Angie Flynn is vastberaden en haar streven naar gerechtigheid komt nooit in het geding. Haar partner rechercheur Oscar Vega blijft haar rots in de branding met zijn no-nonsense houding en methodische aanpak. Rechercheur Brian Lucas is niet langer het “groentje”, een rol die hij met liefde nu laat aan agent Wendy Sung. Een nieuwe commandant zorgt voor een frisse wind met sergeant Mark Cross als nieuw teamlid. Hij en Angie hebben een mysterieuze connectie, zij zou deze liever in het verleden laten.